Einige Gattungen und Arten der Dinoflagellaten können starke Toxine bilden. Dazu gehört etwas das Saxitoxin der Gattung Alexandrium (Gonyaulax), das der Schrecken von Muschelzüchtern ist. Reichern die filtrierenden Muscheln dieses Gift an und enden danach als Seafood auf dem menschlichen Speiseplan, können die Schalentiere mit ihrer Giftfracht durchaus zur Henkersmahlzeit werden.
Karenia brevis produziert Brevetoxine – eine massenhafte Vermehrung bezeichnen wir als Rote Flut (red tide). Solche Giftalgenblüten (Harmful algal bloom) sind immer wieder für Massensterben von Fischen, Vögeln und Meeressäugern verantwortlich. Auch das starke Gift von Pfiesteria piscicida ist hoch giftig für Fische und Säugetiere, ob Wal oder Mensch.
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